Truede arter
For at få et stabilt økosystem i Østersøen, er det afgørende at have en høj diversitet af dyrearter og planter. På grund de specielle forhold i Østersøen er der kun få af de såkaldte hjørnestens arter, som andre arter i økosystemet er afhængige af, og som holder hele økosystemet i balance. Østersøtorsken er et eksempel på en af de vigtige arter.
Helcom har oplistet truede arter, som er særligt vigtige for økosystemet. Til sammen er 34 fisk og lampretter fra Østersøen og Kattegat rødlistet og har særligt høj prioritet. Der er stor nedgang bestanden af alle de rødlistede arter hovedsagligt på grund af overfiskning. På listen står tretten forskellige hajer og rokker. Østersøtorsk og laks og andre kommercielle arter er også rødlistede.
Bortset fra fisk er marine havpattedyr, som engang var almindelige i Østersøen og Kattegat, også truede. Bestanden af Marsvin er for eksempel gået ned, blandt andet fordi de bliver fanget i fiskernes garn.
